MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Haloquadratum walsbyi C23 complete genome

Total Repeats: 67781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017459	ATA	2	6	17	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017459	C	6	6	51	56	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NC_017459	AAG	2	6	83	88	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017459	TCT	2	6	126	131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017459	ACA	2	6	150	155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017459	ACG	2	6	162	167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017459	ACT	2	6	174	179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017459	TA	3	6	201	206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017459	TATAT	2	10	208	217	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017459	TA	3	6	240	245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017459	ACCC	2	8	253	260	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12	NC_017459	G	6	6	297	302	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017459	AGA	2	6	325	330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017459	TGA	2	6	350	355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017459	TGGA	2	8	370	377	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017459	CAT	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017459	TTG	2	6	494	499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017459	AGAT	2	8	544	551	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017459	AT	3	6	617	622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017459	ATA	2	6	727	732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802383
21	NC_017459	AAC	2	6	744	749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802383
22	NC_017459	ATC	2	6	770	775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802383
23	NC_017459	TGA	2	6	836	841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
24	NC_017459	ACA	2	6	856	861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802383
25	NC_017459	GAT	2	6	918	923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
26	NC_017459	AGA	2	6	944	949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802383
27	NC_017459	CAT	2	6	1015	1020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802383
28	NC_017459	GTCA	2	8	1164	1171	25 %	25 %	25 %	25 %	385802383
29	NC_017459	ATG	2	6	1198	1203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
30	NC_017459	TGA	2	6	1319	1324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
31	NC_017459	TCAA	2	8	1337	1344	50 %	25 %	0 %	25 %	385802383
32	NC_017459	TCA	2	6	1371	1376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802383
33	NC_017459	TGA	2	6	1406	1411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
34	NC_017459	TGA	2	6	1430	1435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
35	NC_017459	AT	3	6	1448	1453	50 %	50 %	0 %	0 %	385802383
36	NC_017459	TGA	2	6	1499	1504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
37	NC_017459	TCGAA	2	10	1505	1514	40 %	20 %	20 %	20 %	385802383
38	NC_017459	GAA	2	6	1533	1538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385802383
39	NC_017459	T	6	6	1590	1595	0 %	100 %	0 %	0 %	385802383
40	NC_017459	TGA	2	6	1637	1642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
41	NC_017459	TTG	2	6	1654	1659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802383
42	NC_017459	TGA	2	6	1670	1675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
43	NC_017459	ATG	2	6	1825	1830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802383
44	NC_017459	TTC	2	6	1849	1854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802383
45	NC_017459	TTCA	2	8	1871	1878	25 %	50 %	0 %	25 %	385802383
46	NC_017459	TGC	2	6	1916	1921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802383
47	NC_017459	GCT	2	6	1926	1931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802383
48	NC_017459	ACTT	2	8	1963	1970	25 %	50 %	0 %	25 %	385802383
49	NC_017459	ATC	2	6	2118	2123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802383
50	NC_017459	AT	3	6	2173	2178	50 %	50 %	0 %	0 %	385802383
51	NC_017459	TTG	2	6	2278	2283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802383
52	NC_017459	AATT	2	8	2421	2428	50 %	50 %	0 %	0 %	385802383
53	NC_017459	TGC	2	6	2554	2559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802384
54	NC_017459	TCA	2	6	2675	2680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802384
55	NC_017459	AAT	2	6	2761	2766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802384
56	NC_017459	ATAA	2	8	2794	2801	75 %	25 %	0 %	0 %	385802384
57	NC_017459	CCA	2	6	2816	2821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802384
58	NC_017459	GAC	2	6	2860	2865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802384
59	NC_017459	GTT	2	6	2903	2908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802384
60	NC_017459	TCAC	2	8	2909	2916	25 %	25 %	0 %	50 %	385802384
61	NC_017459	CAC	2	6	2928	2933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385802384
62	NC_017459	GGC	2	6	2978	2983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802384
63	NC_017459	C	6	6	3069	3074	0 %	0 %	0 %	100 %	385802384
64	NC_017459	TCA	2	6	3248	3253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802384
65	NC_017459	TAA	2	6	3324	3329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017459	CGT	2	6	3334	3339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017459	TAA	2	6	3373	3378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017459	GAG	2	6	3401	3406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017459	CAAC	2	8	3419	3426	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017459	ACCA	2	8	3431	3438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017459	TCT	2	6	3477	3482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017459	AATT	2	8	3498	3505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017459	GAT	2	6	3695	3700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802385
74	NC_017459	CTG	3	9	3714	3722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802385
75	NC_017459	ATA	2	6	3801	3806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802385
76	NC_017459	AAT	2	6	3872	3877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802385
77	NC_017459	TCA	2	6	3896	3901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802385
78	NC_017459	TCA	2	6	4076	4081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802385
79	NC_017459	ATT	2	6	4154	4159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802385
80	NC_017459	GTTA	2	8	4162	4169	25 %	50 %	25 %	0 %	385802385
81	NC_017459	TCGA	2	8	4177	4184	25 %	25 %	25 %	25 %	385802385
82	NC_017459	A	6	6	4186	4191	100 %	0 %	0 %	0 %	385802385
83	NC_017459	TTG	2	6	4203	4208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802385
84	NC_017459	ACA	2	6	4220	4225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802385
85	NC_017459	TGT	2	6	4270	4275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802385
86	NC_017459	TGA	2	6	4291	4296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802385
87	NC_017459	CTG	2	6	4395	4400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802385
88	NC_017459	GCG	2	6	4415	4420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802385
89	NC_017459	ATG	2	6	4461	4466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802385
90	NC_017459	TGC	2	6	4480	4485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385802385
91	NC_017459	CA	3	6	4493	4498	50 %	0 %	0 %	50 %	385802385
92	NC_017459	GAT	2	6	4574	4579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802385
93	NC_017459	TTG	2	6	4590	4595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802385
94	NC_017459	TTC	2	6	4659	4664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802385
95	NC_017459	ACG	2	6	4680	4685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802385
96	NC_017459	TGA	3	9	4717	4725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802385
97	NC_017459	ATG	2	6	4749	4754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802385
98	NC_017459	TGA	2	6	4828	4833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802385
99	NC_017459	ATG	2	6	4869	4874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802385
100	NC_017459	A	7	7	4903	4909	100 %	0 %	0 %	0 %	385802385
101	NC_017459	CTC	2	6	4920	4925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802385
102	NC_017459	TAA	2	6	4971	4976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385802385
103	NC_017459	ATG	2	6	5040	5045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802385
104	NC_017459	GGCA	2	8	5070	5077	25 %	0 %	50 %	25 %	385802385
105	NC_017459	CGGT	2	8	5093	5100	0 %	25 %	50 %	25 %	385802385
106	NC_017459	AAT	2	6	5246	5251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017459	GTG	2	6	5321	5326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017459	GTT	3	9	5355	5363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802386
109	NC_017459	GCA	3	9	5415	5423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802386
110	NC_017459	CTCA	2	8	5435	5442	25 %	25 %	0 %	50 %	385802386
111	NC_017459	ACA	2	6	5448	5453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802386
112	NC_017459	CGC	2	6	5477	5482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802386
113	NC_017459	TTG	2	6	5518	5523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802386
114	NC_017459	TG	3	6	5538	5543	0 %	50 %	50 %	0 %	385802386
115	NC_017459	GTTT	2	8	5596	5603	0 %	75 %	25 %	0 %	385802386
116	NC_017459	TTC	2	6	5612	5617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385802386
117	NC_017459	GTT	2	6	5661	5666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802386
118	NC_017459	TCA	2	6	5679	5684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802386
119	NC_017459	TGT	2	6	5711	5716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802386
120	NC_017459	TCCATA	2	12	5832	5843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802386
121	NC_017459	AC	3	6	5854	5859	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017459	TAT	3	9	5900	5908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017459	C	8	8	5989	5996	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
124	NC_017459	TAT	2	6	6160	6165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017459	TC	3	6	6171	6176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017459	TGG	2	6	6244	6249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802387
127	NC_017459	CGG	2	6	6300	6305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385802387
128	NC_017459	TGT	2	6	6331	6336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802387
129	NC_017459	TGA	2	6	6373	6378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802387
130	NC_017459	CGC	2	6	6391	6396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802387
131	NC_017459	CT	3	6	6464	6469	0 %	50 %	0 %	50 %	385802387
132	NC_017459	GTG	2	6	6474	6479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802387
133	NC_017459	TGA	2	6	6508	6513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802387
134	NC_017459	ATT	2	6	6521	6526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385802387
135	NC_017459	GTG	2	6	6537	6542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385802387
136	NC_017459	TGT	2	6	6601	6606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802387
137	NC_017459	ATG	2	6	6639	6644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802387
138	NC_017459	ACA	2	6	6647	6652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385802387
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267	NC_017459	AT	4	8	12589	12596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_017459	TTG	2	6	12619	12624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
269	NC_017459	CGG	2	6	12651	12656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_017459	TAC	2	6	12661	12666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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272	NC_017459	CGA	2	6	12781	12786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385802391
273	NC_017459	GAT	2	6	12891	12896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385802391
274	NC_017459	TCC	2	6	12899	12904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385802391
275	NC_017459	TGT	2	6	12924	12929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385802391
276	NC_017459	ATC	2	6	12935	12940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385802391
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279	NC_017459	AT	3	6	13039	13044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_017459	ACT	2	6	13058	13063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_017459	TCG	2	6	13068	13073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_017459	ATT	2	6	13119	13124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_017459	ATT	2	6	13186	13191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_017459	ATATA	2	10	13286	13295	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_017459	ATT	2	6	13333	13338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_017459	ACA	2	6	13356	13361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_017459	GCC	2	6	13447	13452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802392
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298	NC_017459	TCGT	2	8	14072	14079	0 %	50 %	25 %	25 %	385802393
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386	NC_017459	GTAT	2	8	17765	17772	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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392	NC_017459	GT	3	6	17942	17947	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
393	NC_017459	A	6	6	17956	17961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
394	NC_017459	GTG	2	6	18018	18023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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397	NC_017459	GCC	2	6	18108	18113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385802396
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401	NC_017459	AT	3	6	18252	18257	50 %	50 %	0 %	0 %	385802396
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